Beiträge von Optima MUW

  • PhD or post-doctoral researcher positions: Medical Image Computing with Deep Learning (full time)

    PhD student in Medical Image Computing with Deep Learning (full time)

    We are offering a fully funded PhD position at the Optima Lab (Medizinische Universität Wien). The focus of the research project is on learning and predicting patient-specific disease progression and treatment response from in-vivo imaging (longitudinal series of 3D optical coherence tomography (OCT) images) and non-imaging data (e.g., clinical reports) using medical image analysis and deep learning methods. These data-driven disease-progression models allow to assess individualized risk and prognosis of retinal disease. Advancements will have a real world impact on clinical management of patients suffering from retinal diseases, a leading cause of blindness today.

    We are seeking outstanding PhD candidates to complement our interdisciplinary, multinational research group. Your highly attractive PhD project will be integrated in the currently flourishing field of AI for retinal image analysis (see our recent review paper: https://bit.ly/2MREzTd). It may include aspects of medical image analysis and machine learning topics (deep learning, generative/probabilistic models) on extremely well-curated large-scale longitudinal OCT datasets (examples of our work: https://arxiv.org/abs/1703.05921, https://bit.ly/2Q3HA0t, https://bit.ly/2NOMAET, https://bit.ly/2MKUdjb).

    Your qualifications:

    • MSc degree or equivalent in computer science or another relevant discipline
    • Experience in machine/deep learning, computer vision, medical image analysis, statistics, biomedical imaging or a related discipline
    • Strong programming (Python, R, Julia, PyTorch, etc.) and applied math skills
    • Excellent analytical, interpersonal, as well as written and oral communication skills in English.

    Our offer:

    • You will be immersed into an interdisciplinary environment working closely with a team of computer scientists, software engineers and medical experts.
    • You will have the opportunity to work in the promising and currently exploding fields of machine learning (i.e. deep learning), data science and medical image computing.
    • Access to extremely large sets of curated and annotated ophthalmic images.
    • The lab is well-equipped with a dedicated high-performance computing cluster containing the latest generation GPUs.
    • The group keeps close collaboration with several high-performance academic research institutions, as well as partnership with imaging device and pharmaceutical companies.

    Please send applications including a CV and a cover letter indicating your interests and research experience, and/or any inquiries to: hrvoje.bogunovic (at) meduniwien.ac.at

    Female candidates are explicitly encouraged to apply!


    Postdoc in Machine Learning for Medical Image Analysis (full time)

    We are seeking exceptionally motivated postdocs to strengthen our interdisciplinary team working on machine learning for medical image analysis. As part of our new initiative on Artificial Intelligence in Retina you will be leading exciting projects, at the interface of machine learning and medicine (see our recent review paper). The focus of the research is on automated characterization of retinal pathology from 3D optical coherence tomography (OCT) images of human retina, and on learning to predict patient-specific disease progression from a very large-scale curated imaging data and electronic health records. The goal is to enable an effective AI-based clinical decision support for retinal specialist, in a close collaboration with a leading OCT device manufacturer.

    The successful candidate will be immersed into an interdisciplinary environment working closely with a team of computer scientists, software engineers and medical doctors. Advancements will have a real world impact on clinical management of patients suffering from retinal diseases, a leading cause of blindness today

    Your profile:

    • PhD degree (or soon to be completed) in a relevant discipline
    • Strong background in machine and deep learning, medical image analysis or computer vision
    • Ability to organize his/her work with minimal supervision and to meet deadlines of the project
    • Relevant publication record in the field
    • Excellent programming skills (Python, Julia, PyTorch, etc.)
    • Excellent analytical, interpersonal, as well as written and oral communication skills in English are essential

    Application:

    • Your cover letter with a summary of your previous and present scientific activities and your motivations
    • CV
    • The 2 most significant publications
    • Contact information of three references

    The position is opened immediately until filled, early applications will be given priority.

    Please send applications to: hrvoje.bogunovic (at) meduniwien.ac.at

    Female candidates are explicitly encouraged to apply!

  • ubook aktion

    Wenn man ein kompaktes Notebook sucht, ist auch der Acer Timeline 3810T (http://geizhals.at/a436684.html) eine Überlegung wert.

    Ist kompakt (13,3"), hat eine super Akku-Laufleistung und ist leistungsmäßig sehr ok, wenn man die Dualcore-Version nimmt. Und das Preis/Leistungsverhältnis ist sehr gut.

    Ich bin jedenfalls sehr zufrieden damit.

    Einizige Nachteile sind das fehlende CD/DVD Laufwerk und das verspiegelte etwas kontrastarme Display.

  • Software zum Notenschreiben

    Da fällt mir auf die schnelle Sibelius ein. (http://www.sibelius.com/home/index_flash.html). Es ist eine Profi-Notationssoftware und leider nicht Freeware.

    Ansonsten arbeite ich oft mit Programmen, die deine Anforderungen auch erfüllen, die aber den Schwerpunkt auf Gitarren legen, und sehr Tabulatur-orientiert sind.
    Das ist einerseits das kostenpflichtige Guitar-Pro (http://www.guitar-pro.com/), sowie das Freeware-Programm TuxGuitar (http://www.tuxguitar.com.ar/) welches unter Java läuft.

  • Demo gegen Astrologie!

    Zitat von AntiBit


    Nicht alles ist wissenschaftlich erklärbar und wird es auch vermutlich nie sein. Wichtig ist nur, Scharlatane und Falschtuer auszufiltern, aber deswegen solle man nicht nur an wissenschaftliche Regeln glauben.


    Aber wenn man Astrologie kritisch und wissenschaftlich hinterfragt, dann kommen so gravierende logische Widersprüche raus, dass ich persönlich dazu neige, die Astrologie als Gesamtes als Scharlatanerie abzutun.
    Einige der Einsprüche sind hier ganz gut zusammengefasst:
    http://www.astronomie.de/bibliothek/astrologie/gegner.htm

  • Demo gegen Astrologie!

    Ich zitiere mal aus Cosmic Trigger 2 von R.A.Wilson:

    Zitat


    In all den Diskussionnen zwischen Astrologen und ihren Kritikern ist mir noch nie zu Ohren gekommen, dass jemand einfach darauf hinweist, dass, sogar wenn Astrologie 'wahr' ist, sie trotzdem nur ein Faktor unter vielen bleibt.
    Ein "ehrlicher" und synergetischer Astrologe müsste also auch Sozialpsychologe, Volkswirtschaftler, Ökologe, Historiker, Soziologe, Anthropologe usw. sein, da keiner von uns alleine [...] in einem künstlichen Ökosystem im Weltraum lebt. Wir leben auf einem Planeten mit bestimmten Ressourcen und Grenzen und werden von jedem Menschen, der vor uns lebte, beeinflusst, und von all den Menschen, die zeitgleich mit uns leben, und von der ganzen menschlichen Geschichte, Kunst und Erfindungen.

    Steinhardt würde wahrscheinlich sagen, wir leben in einem komplexen "Wechselwirkungsgeflecht".
    Und das ist, meiner Meinung ein Grund, warum Astrologie und Verschwörungstheorien usw. so viel Zulauf und Zuspruch finden. Sie liefern einfache Antworten auf nicht erfassbare Zusammenhänge, sie bringt mir ein wenig Gewissheit in einer ungewissen Zukunft. Das unseriöse daran ist aber, dass man die Zukunft einfach nicht vorhersagen kann, die Zukunft besteht aus einem Zufallsrauschen und ist nicht mal annähernd determinierbar. Wir können das Wetter nur für ein paar Tage annähernd voraussagen, wie soll man dann z.B. die nächsten 10 Jahre vorraussagen können, wenn das System, das wir betrachten, also das Soziale, Politische u.ä. mindestens so dynamisch wie das Wetter ist. Ich halte sogar Zukunftsforscher für unseriös, die versuchen Voraussagen auf 10 oder mehr Jahre zu machen. Und deshalb kann ich so Sachen, wie ein Geburtshoroskop einfach nicht akzeptieren, was mir ja vorraussagt, in welchen Bahnen mein restliches Leben verlaufen wird.

  • die japanische Kultur rulez

    Ich arbeite derzeit in Japan, und ich kann sagen, es ist schon sehr leiwand da :) Die Leute sind wirklich viel zuvorkommender und höflicher als in Wien. Der Kassierer am Supermarkt verbeugt sich vor dir, bevor er dich bedient, in Wien wirst da höchstens finster angeschaut. In manchen Restaurants knieen sogar die KellnerInnen wenn sie die Bestellung aufnehmen :) Wenn ich mir dagegen so ein Wiener Cafe vorstelle, wo man teilweise mit einem hauch von Verachtung und viel Grant bedient wird...
    Sehr gut sind die öffentlichen Verkehrsmittel, sehr günstig, hohe Frequenz und wirklich immer auf die Minute pünktlich.
    Aber das beste sind sicher die Klos mit eingebautem Bidet und Sitzheizung, wenn ich mal Geld und eine Eigentumswohnung oder ein Haus habe, dann kommt da auch so ein WC rein :)
    Gestohlen wird hier auch extrem wenig, ich glaub man kann seine Brieftasche überall liegen lassen, und wird sie später noch immer mit dem gleichen Inhalt vorfinden.
    Und Tokyo ist sowieso eine Stadt, die man unbedingt mal gesehen haben muss, komplett strange irgendwie :)

    Nicht so toll sind die strengen Hierarchien, die hier überall in der Arbeitswelt herrschen, einem Vorgesetzten wird man z.B. nie widersprechen, das ist unmöglich. Und auch nicht so toll ist, dass hier extrem lang gearbeitet wird, zwar nicht immer effizient, aber dafür sehr lang. Und flexibel sind sie auch nicht, alles läuft nach Checklisten ab, was ja den Vorteil hat, wenn man bekannte Arbeitsabläufe hat, aber wenn es mal wo ein Problem gibt, und keine passende Checkliste, sondern wo man improvisieren müsste, dann stehen sie meistens an.

    Zitat von Ass-Programmer

    jaja die japaner
    AAALso in Japan ist rülpsen ein zeichen von mir gehts gut alles ok...


    Das glaub ich so nicht, zumindest hab ich noch keinen rülpsenden Japaner erlebt. Und während dem Essen rülpsen ist sogar sehr unhöflich.
    Ich glaub das verwechselst du mit Taiwan oder China, dort wird wirklich sehr oft gerülpst, meistens während oder nach dem Essen. An das muss man sich erst mal gewöhnen.

    Zitat


    in Japan gilt den Rotz hochziehen als Akt der Selbstbeherrschung und Schnuetzen als etwas sehr grindiges das man nur auf der Toilette machen sollte...

    Ja, das kann ich so bestätigen, wenn man beim Essen sich schnäuzt, dann vergeht den meisten Japanern der Appetit.

    Zitat


    PROHIBITION rulez
    (bissi saufen is ok aber diese SAFTLER sind ja echt das letzte)

    In Japan haben sie ganz gutes Bier, und die Japaner trinken nicht gerade wenig davon :)

  • Islam in versch. Ländern vs. Menschenrechte

    Zitat von bitterli

    wie wärs mit einer kombi von kreationismus und evolutionstheorie? gott hat mit hilfe der gesetzmäßigkeiten der naturwissenschaft die welt und den menschen erschaffen.

    Aber für was brauche ich dann hier noch Gott? Wenn ich die Gesetzmäßigkeiten nicht als Gott-gegeben sondern nur als gegeben hinnehme, ohne das ich mir einen Gott/Göttin dahinter vorstelle, funktioniert das Werk trotzdem ganz gleich.

    Meiner Meinung nach hat Gott keinen Platz in der Wissenschaft, außer er heißt 'Zufall'. Der Gott-glaube besteht auch immer noch aus unserer deterministischen Sichtweise, wo eben alles irgendwie geplant sein muss. Inzwischen weiß man aber sehr wohl, dass die Welt eben nicht deterministisch aufgebaut ist, sondern durch und durch von zufälligen, nicht genau vorhersagbaren Ereignissen gestaltet wird.

    Der Eintritt des Todes ist auch ein statistischer Zufall, nur hilft diese Erkenntnis den Verwandten nicht unbedingt bei der Trauer. Und hier und in anderen Lebenssituationen kann Religion sehr wohl einen wichtigen Platz einnehmen (aber muss nicht).

  • Wahlwerbung loswerden?

    Zitat von Plantschkuh!

    Ist die Adresse direkt auf den Brief aufgedruckt, oder klebt ein Pickerl drauf?

    Also, bei mir ist die Adresse kein Pickerl, sondern direkt aufgedruckt. Würde mich auch interessieren, wo die meine Adresse her haben. Weil normalerweise gebe ich diese nur sehr ungern her, also nur da, wo ich wirklich muss, um eben solche Werbebriefe zu vermeiden.

  • Islam in versch. Ländern vs. Menschenrechte

    Also, ich halte Säkularisierung für was äußerst wichtiges. Man sieht ja eh an vielen Beispielen, was raus kommt wenn die fundamentalistischen Kirchen ihre extrem konservativen, rückwärtsgerichteten Ansichten in die Gesetzgebung indoktrinieren. Damit meine ich nicht [edit]nur[/edit] den Fall Pakistan oder andere muslimische Staaten, sondern auch "christliche" Staaten, wie die USA, wo die fundamentalen Kirchen auch einen recht großen Einfluß haben.

  • Islam in versch. Ländern vs. Menschenrechte

    Zitat von Rageboom

    (kreationismus, evolution, usw)

    auch hier wird den leuten schwerst zwingend vorgeschrieben was sie zu glauben haben und was nicht. sogar diejenigen, die jeden tag schon zum frühstück das wort "wissenschaftlich" zu sich nehmen, damit sie ihn den ganzen tag parat haben, sind plötzlich gaaaaaaaaanz ruhig wenns darum geht dagegen vorzugehen, dass theorien, die mehr den glauben als das wissen betreffen als tatsachen verkauft werden.

    weder der kreationismus, noch die evolutionstheorie sind bewiesen oder können tatsächlich auch bewiesen werden. da an jedem knochen millionen von fördergelder hängen, muss der knochen ein zeitalter beweisen und auch bei einer möglichen schöpfung war keiner dabei. so gesehen sollte man beide theorien stehen lassen und jeder darf sich daraus nehmen, was er für richtig hält.
    es gibt theologen, die keineswegs an die schöpfung glauben und es gibt stockatheistische (!!!) und gottesleugnende wissenschaftler, die mit der evolutionstheorie schlitten fahren und sie zerpflücken. aber hauptsache das bildungssystem wird dazu mißbraucht, kinder mit glaubensfragen als tatsachen zu vernebeln.

    Sorry Rageboom, aber da schreibst einfach nur noch einen Topfen. Evolutionstheorie und die Mendel'sche Vererbungslehre sind ein gutes Modell. Aber wie gesagt, es ist nur ein Modell und bildet nicht die vollständige Realität zur vollsten Zufriedenheit ab, wie gesagt, es ist eine Theorie. Aber sie funktioniert im Großen und Ganzen. Und wenn man beachtet, wie die Theorie entstanden ist, nämlich auf Wissenschaftlicher Basis, durch Beobachtung und Interpretation. Heute wird eher an Details an der Evolutionstheorie gefeilt, kaum ein ernsthafter Wissenschaftler wird sie als Ganzes anzweifeln.

    Kreationismus dagen ist keine Theorie, sondern ein Glauben. Hier wird zwanghaft versucht, vorhandene Tatsachen in das kreationistische Schema zu pressen, Zusammenhänge werden hergestellt, wo keine sind, Schlussfolgerungen werden gezogen, wo man keine ziehen kann, und wenn was nicht passt, wirds einfach ignoriert. Mit Wissenschaft hat das ungefähr gleich viel zu tun, wie Schwarzenegger ein Charakterdarsteller ist.

    http://www.venganza.org/about/open-letter/

    Die Argumentation vom fliegenden Spaghettimonster geht nach der gleichen Methodik wie Kreationismus vor, und kommt auch zu plausiblen Schlussfolgerungen, nur kann man die Behauptungen nicht beweisen. Müsste sie dann nicht auch eine gleichwertige Theorie neben Evolutionstheorie und Kreationismus sein?

  • Fachschaft lässt Accounts schließen

    Zitat von clairegrube


    im übrigen gehts in dem thread eh nur mehr darum, dass ein paar leute unbedingt der fsinf einiges an den kopf werfen wollen, was irgendwie eh schon ewig her ist..

    es wär an der zeit aktuelle gründe zu nennen, warum man sich denn von der fsinf so "überhaupt nicht vertreten fühlt".
    edit: woran mich das ganze erinnert.. alte geschichten aufwärmen und so den anderen irgendwie niedermachen - stadler/strache show dieses frühjahr

    edit2: wär schön, wenn diejenigen die sich von der fsinf nicht vertreten fühlen a) die gründe nennen b) ihre STRV wünsche bekanntgeben, bzw. die wünsche an die fsinf bekanntgeben - nehm nicht an, dass das die leute sind die jeden dienstag zu den sitzungen kommen und da mitarbeiten.


    Nunja, solange studiere ich noch nicht, dass ich irgendwelche alten Geschichten von der FSInf aufwärmen könnte. Mir hat einfach die Drohung sauer aufgestoßen, dass die FSInf dem Forum ihre Unterstützung entziehen soll, und auch die schiefe Optik, die entstanden ist, dass eben Hellsmurf genau gesperrt wird, wenn jemand von der FSInf sich beschwert.
    ABER, mit den Stellungnamen von W-O-G und der FSInf, sowie den Kommentaren von Klausi und M.R.B.E. hat sich das ganze zumindest aus meiner Sicht erledigt. Ich werde mich deshalb hüten, die Äußerungen von Loki auf die ganze Fachschaft umzulegen. Loki bleibt für mich weiterhin nicht wählbar. Sorry, aber mit dieser Aktion hat er sich disqualifiziert, er hätte ja noch die Möglichkeit gehabt, seine Aussagen zu relativieren, oder sie auch zu rechtfertigen, aber mit dem Rückzug aus dem Forum hat er sich diese Möglichkeit ja auch genommen. Aber aufgrund dieser Aktion der ganzen FSInf das Vertrauen zu entziehen halte ich inzwischen für überzogen.

    Just my .05 €